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上海通蔚公司參加浙江大學基困組科學研究班學習
更新時間:2018-06-01   點擊次數:1682次

一、培訓班上課內容 
      上課內容涵蓋“基因組學―蛋白質組學―系統(tǒng)生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。 
核心課程包括: 
1. 基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展(講課人:于 軍 教授) 
2. 轉錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與醫(yī)學(講課人:胡松年教授) 
3. 系統(tǒng)生物學建模分析及高通量分析技術應用(講課人:楊軍、陳銘教授等) 
4. 蛋白質組學概論及應用 (講課人:鐘伯雄教授)

二、培訓班上機內容 
      上機實習課采用 “跟我學”方式,學習實踐各類基礎生物信息學軟件,每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數據分析的基本方法。

主要內容如下: 
實習一: 基因組數據注釋和功能分析
      通過序列比對工具BLAST的學習,了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4,掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法,認識基因復制在進化上的功能;學習基因序列分析常用的數據庫和軟件。 
實習二: 轉錄組數據分析
      介紹轉錄組數據分析的基本流程及其原理;通過對tophat、cufflinks、R等轉錄組數據分析工具的介紹及演示,了解基于二代測序數據的轉錄組分析流程及常用分析方法; 利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉錄組數據的生物學意義。 
實習三:系統(tǒng)生物學軟件實習-----網絡結構顯示與分析 
      利用Cytoscape系統(tǒng)生物學分析軟件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子網絡系統(tǒng),并與基因表達等數據整合。 
實習四:蛋白質結構與功能分析 
      從數據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始,接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析,預測目標蛋白的生物功能。 
實習五: 蛋白質組質譜分析 
      使用X!Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質質譜數據,將質譜結果匹配到蛋白質組數據庫鑒定蛋白;使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學分析和優(yōu)化檢索結果練習。

三、培訓對象 

無生物信息學背景,希望了解生物信息學的學員; 
計劃開展各類組學研究的科研人員; 
已有組學數據需了解分析方法的研究人員; 
有志從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。 

上海通蔚生物科技有限公司

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